Also doch 3 Laufwerke am Readwrite-Signal... Das KANN zu viel sein.
Du könntest versuchen, alle Signale, die der FDC und der Yamaha-Chip am Floppy-Port steuern (DS0, DS1, Read, Step, Side-Select, ...) über einen 74LS244 Bustreiber zu führen. Ich hatte in meinem ST-Tower mal eine Zeit lang vier Floppys (2x 3,5, 2x 5,25) drin, wobei über einen Drehschalter die DS-Signale so umschalten konnte, dass ich folgende Konfigs auswählen konnte (2x 3,5, 2x 5,25, 3,5+5,25, 5,25+3,5), und da hatte ich zunächst auch Probleme, die mit dem 74LS244 gelöst wurden. Nur hab ich dann später ein 5,25 wieder ausgebaut, hab den Platz für ne Platte gebraucht.