An der Lightning VME ist kein NE2000 angeschlossen, sondern ein ASIX-USB-zu-Ethernet-Chip. Aber auch der ist, da stimme ich zu, sicherlich nicht der Flaschenhals. Das sind eher der Netzwerkstack, der für TCP/IP nun einmal eine gewisse Komplexität hat und USB.
Man muss dazu wissen: USB hat keine Interrupts, d.h. ein angeschlossenes Gerät kann nicht via Interrupt dem Host mitteilen, dass es Daten hat -- hier: ein empfangenes Netzwerkpaket. Stattdessen muss der Host USB-Geräte regelmäßig abfragen. Um die Latenz gering und den Datendurchsatz hoch zu halten, möchte man dieses "Polling" natürlich so oft wie möglich durchführen. Für einen PC mit x GHz ist das auch ein Klacks. Am TT mit seinen gerade einmal 32 MHz hingegen sieht man schon, wie die Systemlast ansteigt, wenn man zu oft "pollt". Irgendwann würde der 68030 nur noch USB und Netzwerkstack bedienen. Es gilt also, den Tradeoff zu finden zwischen Netzwerkdurchsatz und CPU-Last.