Du musst vor MiNT set_mmu aufrufen, also nicht per bootstrap. sondern MiNT aus dem auto-Ordner starten. Dieser auto-Ordner muss dann auf einem image, das zunächst C: ist, liegen. Außerdem muss in mint.ini memory-protection an sein.
Ich hab im jit ein image-Laufwerk (SCSI1) erzeugt, mit den files, und das image kopier ich dann im host nach SCSI0, weil C: nachher vom hostfs belegt ist, es kann also nachdem MiNT gestartet ist, nicht mehr angesprochen werden.
Neuere EmuTOS-Versionen haben glaub ich set:mmu eingebaut, das hab ich noch nicht probiert.