MiNT an sich hat damit erstmal herzlich wenig zu tun.
Daß bei SSL die FPU benutzt wird ist auch nicht richtig, das ist hauptsächlich Bitgeschiebe. Würde auch schlecht funktionieren, dazu sind die FPUs/Bibliotheken auf verschiedenen Systemen zu unterschiedlich, und man würde sich früher oder später Rundungsfehler einfangen.
Das Problem sind halt die Programme die für 68020+ übersetzt wurden; wenn sie mathematische Funktionen benutzen, benutzen sie i.d.R. auch die FPU dafür (es gibt zZ. keine mintlib die für 68020+ übersetzt wird, aber Softfloat-Funktionen wie für 68k benutzt, auch wenn das technisch möglich wäre). Du müsstest dann also im Zweifelsfall die 68k-Versionen dieser Programme benutzen, das sollte eigentlich funktionieren.
Es gibt vermutlich ziemlich viele Programme die zwar einige wenige Mathe-Funktionen benutzen, bei denen sich die Geschwindigkeitseinbussen aber in Grenzen halten. Anders sieht es natürlich bei Programmen wie z.B. Povray, Tabellen-Kalkulationen etc.. aus.