Pullup auf jeden Fall mal versuchen.
Wenn es geht, aber auch mal direkt in der Tastatur und Maus nachschauen, wieviel von 5V dort noch ankommen, und auch am Anschluss für Tastatur/Maus am Eiffel-Interface. Dabei als Bezugsmasse auch die Masse in der Tastatur/Maus verwenden. Falls Spannungsunterschied, messen, wieviel Spannung zwischen Rechnermasse und Maus/Tastatur/Eiffel-Masse ist, sollte idealerweise 0V sein. Das selbe mit Rechner-5V am Netzteilstecker/Tastaturstecker gegen 5V von Maus/Tastatur/Eiffel-Masse machen, sollte auch idealerweise 0V sein (das sind insgesamt 6 Messungen bei denen 0V rauskommen sollten!). Falls es nicht 0V sind, dann sind die Leiterbahnen/Kabel auf dem Weg zur Tastatur/Maus zu dünn, haben also zu hohen Widerstand. Versuchsweise mal eine parallele Verbindung legen und dann die gleichen Messungen machen. Falls das hilft, und die Tastatur dann nicht mehr tickert, eine elegante dauerhafte Lösung finden!
Warum das Ganze: Im Atari ist an dem Tastaturanschluss normalerweise nur ein Controller, der IKBD. Im Falle von Eiffel sind es schon drei: Die CPU in Eiffel, die CPU in der Tastatur und der Maus, die Maus hat wahrscheinlich auch noch eine recht helle LED. Und dann gillt eben U=R*I (U=Spannungsabfall, oben gemessen, R=Leitungswiderstand, I=Stromverbrauch der ganzen Chips), und da sieht man, je mehr man dran hängt, um so höher wird der Spannunsabfall.