Das Zynq-Gerät scheint mir dann doch noch ein wenig anders gebaut zu sein: die zwei ARM-Cores (die mit 2x1GHz den 235 MHz Coldfire natürlich locker in die Tasche stecken) sitzen direkt auf dem selben Silizium wie der FPGA-Teil. Das dürfte dann wohl bedeuten, daß die gesamte Peripherie (RAM-Interface, DMA, I/O, usw.) im FPGA abgebildet ist. Für mich sieht das so aus, als ob man sich den gesamten restlichen Microcontroller dann per Software "zusammenstecken" kann.
Bei der FireBee ist die Verschaltung von FPGA, Microcontroller und RAM fix und wesentliche Peripherie-Tele in der Coldfire-CPU eben so, wie sie sind (also nicht änderbar).