Du kannst mir aber gerne mal die Songs schicken, dann schau ich mir das mal an...
Bzgl. falscher Zuordnung (für den Fall dass du die Files ja bereits auf dem Mac öffnen konntest):
Notator arbeitete Pattern-orientiert. In Logic werden diese Pattern in sogenannten "Ordnern" abgebildet, sprich du erhältst oft nur eine Spur mit einem Ordner, der wiederum all deine Patterns enthält. Ein Doppelklick öffnet den Ordnerinhalt, dort findest du dann die 16 oder 32 Tracks des entsprechenden Notator Patterns.
Was etwas mühsam ist, ist die Ordnerstruktur wieder aufzuheben, als normale Spuren anzulegen und die einzelnen Miditracks/Instruments neu zuzuordnen. Je nachdem wie du damals deine Tracks benannt hast oder nicht - kann dies "einige" Zeit in Anspruch nehmen... ;-)
lg